晴朗时节，江户川柯南（高山南配音）和毛利小五郎（小山力也配音）、小兰（山崎和佳奈配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰上的绝密情报。 为了找出隐藏的对手，柯南和灰原哀（林原惠美配音）、阿笠博士（绪方贤一配音）、服部平次（堀川亮配音）以及远山和叶（宫村优子配音）通力合作，与间谍展开连番斗智斗勇的较量…aaa
主演：山口胜平,林原惠美,日高范子,长岛雄一,高山南,井上喜久子,大塚明夫,山寺宏一,佐久间玲,杉田智和,佐仓绫音,森川智之,宫野真守,悠木碧
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主演：高山南,山崎和佳奈,神谷明,小山力也,林原惠美,山口胜平,田中秀幸,岛本须美,绪方贤一,堀川亮,松井菜樱子,宫村优子,岩居由希子,大谷育江,高木涉,高岛雅罗,堀之纪,立木文彦,小山茉美,三石琴乃,置鲇龙太郎,日高法子,池田秀一,古谷彻
主演：宫野真守,今井麻美,花泽香菜,田村由香里,桃井晴子,小林优,后藤沙绪里,关智一,寺杣昌纪,山本彩乃
主演：牧野由依,泽城美雪,茅野爱衣,斋藤千和,西崎莉麻,米泽圆,濑户麻沙美,田中爱美,羽多野涉
主演：松野太纪,中川亚纪子,小杉十郎太,小野健一,内山昂辉
